Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms