Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms