Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms