Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms