Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTTNBP2Q8WZ74 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC29.08■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTTNBP2Q8WZ74 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms