Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DNAJA4Q8WW22 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNAJA4Q8WW22 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms