Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms