Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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RAB11FIP4Q86YS3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
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RAB11FIP4Q86YS3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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RAB11FIP4Q86YS3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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RAB11FIP4Q86YS3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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RAB11FIP4Q86YS3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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RAB11FIP4Q86YS3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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RAB11FIP4Q86YS3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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RAB11FIP4Q86YS3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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RAB11FIP4Q86YS3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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RAB11FIP4Q86YS3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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RAB11FIP4Q86YS3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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RAB11FIP4Q86YS3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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RAB11FIP4Q86YS3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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