Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms