Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms