Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms