Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms