Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR3Q6ZT12 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR3Q6ZT12 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms