Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ATF7IPQ6VMQ6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IPQ6VMQ6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IPQ6VMQ6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IPQ6VMQ6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IPQ6VMQ6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IPQ6VMQ6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IPQ6VMQ6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IPQ6VMQ6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IPQ6VMQ6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IPQ6VMQ6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IPQ6VMQ6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IPQ6VMQ6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IPQ6VMQ6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IPQ6VMQ6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IPQ6VMQ6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IPQ6VMQ6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms