Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms