Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms