Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2H3

CEP85, Centrosomal protein of 85 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP85Q6P2H3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms