Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms