Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms