Protein–RNA interactions for Protein: Q5JST6

EFHC2, EF-hand domain-containing family member C2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC2Q5JST6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFHC2Q5JST6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHC2Q5JST6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms