Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms