Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHB4

SLC5A12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A12Q1EHB4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC5A12Q1EHB4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms