Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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