Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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NRF1Q16656 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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NRF1Q16656 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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NRF1Q16656 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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NRF1Q16656 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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NRF1Q16656 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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NRF1Q16656 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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NRF1Q16656 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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NRF1Q16656 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms