Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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