Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms