Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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