Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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