Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF2Q15853 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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