Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms