Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP4Q15650 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIP4Q15650 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms