Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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