Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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RABEP1Q15276 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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RABEP1Q15276 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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RABEP1Q15276 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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RABEP1Q15276 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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RABEP1Q15276 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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RABEP1Q15276 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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RABEP1Q15276 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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RABEP1Q15276 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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RABEP1Q15276 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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