Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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