Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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BRD3Q15059 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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BRD3Q15059 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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BRD3Q15059 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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BRD3Q15059 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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BRD3Q15059 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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BRD3Q15059 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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BRD3Q15059 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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