Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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