Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD11Q14690 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms