Protein–RNA interactions for Protein: Q14160

SCRIB, Protein scribble homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRIBQ14160 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCRIBQ14160 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SCRIBQ14160 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCRIBQ14160 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCRIBQ14160 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SCRIBQ14160 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SCRIBQ14160 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SCRIBQ14160 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SCRIBQ14160 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SCRIBQ14160 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SCRIBQ14160 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SCRIBQ14160 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SCRIBQ14160 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms