Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCARB2Q14108 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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