Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms