Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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CDH18Q13634 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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CDH18Q13634 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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