Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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