Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms