Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD47Q08722 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD47Q08722 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD47Q08722 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD47Q08722 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD47Q08722 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD47Q08722 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD47Q08722 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD47Q08722 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD47Q08722 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD47Q08722 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD47Q08722 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD47Q08722 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD47Q08722 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD47Q08722 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms