Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms