Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA5Q01523 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms