Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD1P98174 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD1P98174 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD1P98174 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD1P98174 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD1P98174 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD1P98174 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD1P98174 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD1P98174 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD1P98174 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD1P98174 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD1P98174 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD1P98174 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD1P98174 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD1P98174 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD1P98174 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD1P98174 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGD1P98174 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGD1P98174 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGD1P98174 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGD1P98174 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGD1P98174 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD1P98174 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms