Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTD2P86397 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTD2P86397 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTD2P86397 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTD2P86397 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTD2P86397 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTD2P86397 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTD2P86397 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HTD2P86397 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTD2P86397 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms