Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms