Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AQP4P55087 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AQP4P55087 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AQP4P55087 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms